Σαν σήμερα στη ΧΗΜΕΊΑ : 24 Απριλίου

Ο Αμερικανός βιοχημικός Roger Kornberg γεννήθηκε σαν σήμερα το 1941

Του απονεμήθηκε το βραβείο Νόμπελ στη Χημεία το 2006 για τις "μελέτες της μοριακής βάσης της ευκαρυωτικής μεταγραφής" - τη διαδικασία όπου η γενετική πληροφορία αντιγράφεται από το DNA στο RNA.

Ο Roger David Kornberg (γεννημένος 24 Απριλίου 1947) είναι ένας Αμερικανός  βιοχημικός και καθηγητής της δομικής βιολογίας στο Πανεπιστήμιο του Στάνφορντ της Ιατρικής Σχολής. Ο Kornberg έλαβε το Βραβείο Νόμπελ Χημείας το 2006 για τις μελέτες του σχετικά με τη διαδικασία με βάση την οποία η γενετική πληροφορία από το DNA  αντιγράφεται στο RNA "τη μοριακή βάση της ευκαρυωτικής μεταγραφής ".

Ο Κορνμπεργκ γεννήθηκε στο Σαιντ Λούις του Μισσούρι. Είναι ο μεγαλύτερος γιος του βιοχημικού Άρθουρ Κορνμπεργκ , ο οποίος επίσης κέρδισε βραβείο Νόμπελ το 1959 στη Φυσιολογία ή Ιατρική για την ανακάλυψή του "των μηχανισμών της βιολογικής σύνθεσης του δεσοξυριβονουκλεϊκού οξέος (DNA)", και της Sylvy Ruth (Levy) που ήταν επίσης βιοχημικός. Πήρε το πτυχίο του στη Χημεία από το Πανεπιστήμιο του Χάρβαρντ το 1967 και το Ph.D. στη χημική φυσική από το Στάνφορντ το 1972 υπό την επίβλεψη του Harden M. McConnell.

Η λειτουργία της RNA πολυμεράσης II (μεταγραφή).
Ο νέος συντεθείς κλώνος RNA από το ένζυμο (πράσινο).

Όλοι οι οργανισμοί ελέγχονται από τα γονίδια τους, τα οποία κωδικοποιούνται από το DNA, το οποίο αντιγράφεται στο RNA, το οποίο δημιουργεί πρωτεΐνες, οι οποίες είναι αλληλουχίες αμινοξέων. Το DNA βρίσκεται στον πυρήνα. Όταν ένα κύτταρο εκφράζει ένα γονίδιο, αντιγράφει (μεταγράφει) την αλληλουχία DNA του γονιδίου σε αλληλουχία αγγελιαφόρου RNA (mRNA). Το mRNA μεταφέρεται έξω από τον πυρήνα σε ριβοσώματα. Τα ριβοσώματα διαβάζουν το mRNA και μεταφράζουν τον κώδικα στη σωστή ακολουθία αμινοξέων για να κάνουν την πρωτεΐνη αυτού του γονιδίου.

Το DNA μεταγράφεται σε mRNA από ένα ένζυμο, RNA πολυμεράση II, με τη βοήθεια πολλών άλλων πρωτεϊνών. Χρησιμοποιώντας  μαγιά, ο Kornberg ταυτοποίησε το ρόλο της RNA πολυμεράσης II και άλλων πρωτεϊνών στη μεταγραφή του DNA και δημιούργησε τρισδιάστατες εικόνες του συμπλέγματος των πρωτεϊνών χρησιμοποιώντας  κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ. Η πολυμεράση II χρησιμοποιείται από όλους τους οργανισμούς με πυρήνες, συμπεριλαμβανομένων των ανθρώπων, για να μεταγράψουν το DNA.

Από τη: Royal Society of Chemistry (RSC) και από την Wikipedia, the free encyclopedia: Roger D. Kornberg

Εικόνα: By Forluvoft - Own work, Public Domain, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2892073
By JWSchmidt - http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/news_publications/newsletters/2003q2/mom.htmlhttps://en.wikiversity.org/wiki/File:Label_RNA_pol_II.png, Public Domain, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=32033313

Σαν σήμερα στη ΧΗΜΕΊΑ :  24 Απριλίου

Η προηγούμενη μέρα                     Όλη η 'Ανοιξη                     Η επόμενη μέρα

Σαν σήμερα στη ΧΗΜΕΊΑ : 26 Οκτωβρίου

Ο Αμερικανός βιοχημικός Arthur Kornberg πέθανε σαν σήμερα το 2007

Διπλασιασμός DΝΑ: Η διπλή έλικα είναι ανοιχτή και ξετυλίγεται
και κάθε ξεχωριστό σκέλος (τυρκουάζ) ενεργεί ως πρότυπο
για την αναπαραγωγή ενός νέου σκέλους εταίρου (πράσινο).
Τα νουκλεοτίδια (βάσεις) ταιριάζουν για να συνθέσουν
τα νέα σκέλη εταίρων σε δύο νέες διπλές έλικες

Μοιράστηκε το Βραβείο Νόμπελ Φυσιολογίας ή Ιατρικής του 1959 για την ανακάλυψη του μηχανισμού, του τρόπου, με τον οποίο αναπαράγεται το δεσοξυριβονουκλεϊκό οξύ (DNA) στα βιολογικά συστήματα και πολλά από τα ένζυμα και τα δομικά στοιχεία που απαιτούνται κατά μήκος της οδού. Αυτά τα ευρήματα ήταν θεμελιώδη για την κατανόηση της γενετικής.

Το DNA αποτελείται από μια διπλή έλικα δύο συμπληρωματικών κλώνων. Κατά τη διάρκεια του αναδιπλασιασμού, αυτοί οι κλώνοι διαχωρίζονται. Κάθε κλώνος του αρχικού μορίου DΝΑ στη συνέχεια χρησιμεύει ως πρότυπο για την παραγωγή του ομολόγου του, μια διαδικασία που αναφέρεται ως ημι-συντηρητική αναπαραγωγή. H κυτταρική διόρθωση και ο μηχανισμός ελέγχου σφαλμάτων εξασφαλίζουν σχεδόν τέλεια πιστότητα για την αντιγραφή του DNA.

 Σε ένα κύτταρο, η αντιγραφή του DNA ξεκινά σε συγκεκριμένες θέσεις, ή στις ενάρξεις του αναδιπλασιασμού, στο γονιδίωμα. Αφού ξεδιπλωθεί το DΝΑ στην "έναρξη" σχηματίζεται κάτι σαν διχάλα και ο κάθε μονός κλώνος της διχάλας συμπληρώνεται και παράγονται δύο νέα μόρια. Ένας αριθμός πρωτεϊνών συνδέονται με τις διχάλες αναδιπλασιασμού για να βοηθήσουν στην έναρξη και συνέχιση της σύνθεσης DΝΑ. Πιο συγκεκριμένα, η DΝΑ πολυμεράση συνθέτει τους νέους κλώνους προσθέτοντας νουκλεοτίδια που συμπληρώνουν κάθε κλώνο (πρότυπο). Ο αναδιπλασιασμός του DNA συμβαίνει κατά τη διάρκεια του σταδίου S της ενδιάμεσης φάσης του διπλασιασμού του κυττάρου.

Ο αναδιπλασιασμός του DNA μπορεί επίσης να διεξαχθεί in vitro (τεχνητά, έξω από ένα κύτταρο). Οι DΝΑ πολυμεράσες που απομονώνονται από κύτταρα και μόρια που τεχνητά εκκινούν το διπλασιασμό του DΝΑ μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την έναρξη σύνθεσης νέου DΝΑ σε γνωστές όμως αλληλουχίες από ένα μόριο DΝΑ εκμαγείου. Η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR), μια κοινή εργαστηριακή τεχνική, εφαρμόζει κυκλικά τέτοια τεχνητή σύνθεση για να ενισχύσει (πολλαπλασιάσει) ένα συγκεκριμένο θραύσμα DΝΑ.

Από τη: Royal Society of Chemistry (RSC)
Εικόνα: By I, Madprime, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2497221

Επίσης σαν σήμερα το 1944 υπογράφηκε το καταπίστευμα για το Petroleum Research Fund.

Το Ταμείο Έρευνας πετρελαίου είναι ένα καταπιστευμένο ταμείο, το οποίο διαχειρίζεται η American Chemical Society (Αμερικανική Ένωση Χημικών), το οποίο στηρίζει θεμελιώδεις έρευνες που σχετίζονται άμεσα με το πετρέλαιο ή τα ορυκτά καύσιμα σε μη κερδοσκοπικούς οργανισμούς (γενικά κολλέγια και πανεπιστήμια) στις Ηνωμένες Πολιτείες και σε άλλες χώρες.

Το έγγραφο της συμφωνίας μεταξύ των επτά εταιριών: 1) SHELL OIL COMPANY, INCORPORATED, 2) STANDARD OIL COMPANY OF CALIFORNIA, 3) STANDARD OIL COMPANY (Indiana) 4) STANDARD OIL COMPANY (New Jersey) 5) THE TEXAS COMPANY 6) N. V. de BATAAFSCHE PETROLEUM MAATSCHAPPIJ και 7) GUARANTY TRUST COMPANY OF NEW YORK, υπογράφηκε στις 26 Οκτωβρίου 1944

https://www.acs.org/content/dam/acsorg/funding/grants/prf/about/history/prf-trust-agreement.pdf

Πηγή: This Week in the History of Chemistry

Επίσης σαν σήμερα το 1874 γεννήθηκε ο Martin Lowry που είναι γνωστός για τη θεωρία οξέων κατα Bronsted-Lowry.

Ο Thomas Martin Lowry CBE FRS (26 Οκτωβρίου 1874 - 2 Νοεμβρίου 1936) ήταν ένας Άγγλος φυσικοχημικός που ανέπτυξε τη θεωρία βάσης οξέος Brønsted-Lowry ταυτόχρονα αλλά και ανεξάρτητα από τον Johannes Nicolaus Brønsted και ήταν ιδρυτικό μέλος και πρόεδρος (1928-1930) της Faraday Society.

Το οξικό οξύ, ένα ασθενές οξύ, δίδει ένα πρωτόνιο (ιόν υδρογόνου, που επισημαίνεται σε πράσινο χρώμα) σε νερό με αμφίδρομη αντίδραση για να παραχθεί το οξικό ιόν και το κατιόν υδρογόνου. Κόκκινο: οξυγόνο, μαύρο: άνθρακας, λευκό: υδρογόνο.
Credit: Υπό Ben Mills - Own work, Public Domain, Wikipedia Commons 

Το 1898, ο Lowry παρατήρησε την αλλαγή στην οπτική στροφική ικανότητα στη νιτρο-δ-καμφορά καθώς περνάει ο χρόνος και εφηύρε τον όρο  mutarotational για να περιγράψει αυτό το φαινόμενο. Μελέτησε τις αλλαγές στην οπτική στροφική ικανότητα που προκαλούνται από αντιδράσεις  που καταλύονται με οξύ ή βάση σε παράγωγα της καμφοράς. Αυτό τον οδήγησε το 1923 στη διατύπωση του πρωτονιακού ορισμού των οξέων και βάσεων, γνωστή σήμερα ως θεωρία βάσης οξέος Brønsted-Lowry, ανεξάρτητα από το έργο του Johannes Nicolaus Brønsted. 

Ο Lowry δημοσίευσε μερικές εκατοντάδες έγγραφα και πολλά βιβλία. Η μονογραφία του για την «Οπτική στροφική ικανότητα» του 1935 θεωρείται για χρόνια ως πρότυπη εργασία για το θέμα

Πηγή: The Royal Society από δημοσίευση στο Facebook και Wikipedia, the free encyclopedia

Σαν σήμερα στη ΧΗΜΕΊΑ :  26 Οκτωβρίου

Η προηγούμενη μέρα                      Όλο το Φθινόπωρο                     Η επόμενη μέρα

Αρχαίο DNA αποκαλύπτει ότι οι Έλληνες έχουν πραγματικά μυθική προέλευση

Από την εποχή του Ομήρου, οι Έλληνες έχουν εξιδανικεύσει τους μυκηναϊκούς "προγόνους" τους σε επικά ποιήματα και κλασικές τραγωδίες όπου δοξάζουν τα κατορθώματα του Οδυσσέα, του Αγαμέμνονα και άλλων ηρώων καθώς κερδίζουν ή χάνουν την συμπάθεια των θεών. Αν και αυτοί οι μυκηναίοι ήταν μυθικά πρόσωπα, μελετητές εξέτασαν αν οι σημερινοί Έλληνες προέρχονται από εκείνους  τους αρχαίους Μυκηναίους, που δημιούργησαν τον διάσημο πολιτισμό που κυριαρχούσε στην ηπειρωτική Ελλάδα και το Αιγαίο από το 1600 π.Χ. έως το 1200 π.Χ. ή αν οι αρχαίοι Μυκηναίοι απλώς εξαφανίστηκαν από την περιοχή.

Εικόνες και ταινίες εγγράφονται στο DNA βακτηρίων;

Το αριστερό πλαίσιο είναι μία ταινιούλα που δείχνει το άλογο “Sallie Gardner at a Gallop (1878)” να καλπάζει. Η ταινιούλα αυτή κωδικοποιείται σε  νουκλεοτίδια  και με το σύστημα Crispr-Cas9 αποθηκεύεται στο DNA ζωντανών βακτηρίων, Το δεξιό πλαίσιο είναι η ταινιούλα που ανακτάται με τη διαδικασία εύρεσης της αλληλουχίας απο το DNA βακτηρίου απόγονου του αρχικού.
Υπο Seth Shipman 

Το Crispr-Cas9 είναι ένα εργαλείο που χρησιμοποιείται για την αποθήκευση πληροφοριών στο γονιδίωμα ζωντανών Escherichia coli.

Τα τελευταία χρόνια, δεδομένα διαφορετικά μεταξύ τους  όπως τα σονέτα του Σαίξπηρ, ή ο λόγος του Martin Luther King Jr «Έχω ένα όνειρο», ή μια δωροκάρτα 50$ της Amazon έχουν όλα αποθηκευτεί σε DNA. Τώρα, επιστήμονες στις ΗΠΑ στο Harvard University στο Cambridge, Massachusetts έχουν προχωρήσει την ιδέα ένα βήμα παραπέρα, εισάγοντας εικόνες, ή ακόμα και μικρές ταινίες στα γονιδιώματα  ζωντανών βακτηρίων.
Τα αποτελέσματα τους εμφανίζονται στο περιοδικό Nature .